I dipartimenti della scuola sono coinvolti a diverso titolo nelle seguenti Scuole di Dottorato nazionali. 

Scuole di Dottorato con sede amministrativa nei dipartimenti della scuola:  

• Civil, environmental and materials engineering
• Computer and Data Science for Technological and Social Innovation
• Industrial innovation engineering 
• Information and Communication Technologies (ICT)
• Mechanical and vehicle engineering
• Physics and nano sciences

Scuole di Dottorato interateneo con sede amministrativa nei dipartimenti della scuola a rotazione con gli altri atenei coinvolti:

• Automotive engineering for intelligent mobility  (con Bologna e Parma)
• Mathematics (con Ferrara e Parma)